MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacteroides fragilis NCTC 9343 plasmid pBF9343

Total Repeats: 155

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006873	TAA	2	6	38	43	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006873	TAA	2	6	53	58	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006873	TAAA	2	8	121	128	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006873	CCCA	2	8	804	811	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_006873	TGCTT	2	10	832	841	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_006873	T	6	6	840	845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006873	AGGCA	2	10	871	880	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_006873	TC	3	6	944	949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_006873	AT	3	6	957	962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006873	ATA	2	6	980	985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006873	TTA	2	6	1034	1039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006873	ATAA	2	8	1090	1097	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006873	CAAA	2	8	1136	1143	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_006873	TTCC	2	8	2161	2168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_006873	C	6	6	2167	2172	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_006873	G	6	6	2178	2183	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006873	T	6	6	2189	2194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006873	A	6	6	2203	2208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006873	ACCC	3	12	2268	2279	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_006873	GAAA	2	8	2457	2464	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006873	ATG	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006873	A	6	6	2603	2608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006873	TA	5	10	2658	2667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006873	AAT	2	6	2668	2673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006873	AT	3	6	2672	2677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006873	AT	3	6	2680	2685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006873	AT	3	6	2687	2692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006873	AAAC	2	8	2693	2700	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_006873	AT	3	6	2702	2707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006873	TCT	2	6	2763	2768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_006873	TC	3	6	2794	2799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_006873	CAT	2	6	2826	2831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_006873	AAAAG	2	10	2832	2841	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006873	GA	3	6	2918	2923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006873	GAAA	2	8	2930	2937	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006873	ATT	2	6	2987	2992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006873	AAT	2	6	3061	3066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006873	TAT	2	6	3072	3077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006873	AAAC	2	8	3129	3136	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_006873	CAAA	2	8	3173	3180	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_006873	CTT	2	6	3195	3200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_006873	T	7	7	3257	3263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006873	ATT	2	6	3522	3527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006873	AAAG	2	8	3812	3819	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006873	ACAGT	2	10	4418	4427	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_006873	AGT	2	6	7197	7202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006873	TATC	2	8	7203	7210	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_006873	TAC	2	6	7223	7228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_006873	TAAA	2	8	7243	7250	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006873	CCTA	2	8	7261	7268	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_006873	A	6	6	7273	7278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006873	TTA	2	6	7289	7294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006873	A	8	8	7366	7373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006873	ACT	2	6	7389	7394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_006873	A	7	7	7425	7431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006873	T	6	6	7467	7472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006873	AGGAA	2	10	7484	7493	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006873	TA	3	6	7533	7538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006873	ATG	2	6	7541	7546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006873	A	6	6	7608	7613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006873	CTG	2	6	7614	7619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_006873	A	6	6	7632	7637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006873	AGA	2	6	7664	7669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006873	TA	5	10	7687	7696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006873	AAT	2	6	7697	7702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006873	AT	3	6	7709	7714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006873	AT	3	6	7716	7721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006873	AAAC	2	8	7722	7729	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_006873	AT	3	6	7731	7736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006873	AT	3	6	7738	7743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006873	AAAC	2	8	7744	7751	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_006873	AT	3	6	7753	7758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006873	TCT	2	6	7814	7819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_006873	TC	3	6	7845	7850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_006873	CAT	2	6	7877	7882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_006873	GA	3	6	7969	7974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006873	TTTG	2	8	8062	8069	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006873	TA	3	6	8088	8093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006873	AT	3	6	8195	8200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006873	TA	4	8	8580	8587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006873	AT	4	8	8594	8601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006873	TC	3	6	8660	8665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_006873	CAT	2	6	8692	8697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_006873	AAAAG	2	10	8698	8707	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006873	CTGC	2	8	8772	8779	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_006873	GA	3	6	8784	8789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006873	ATT	2	6	8853	8858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006873	A	6	6	8867	8872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006873	TA	5	10	8889	8898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006873	AAT	2	6	8899	8904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006873	AT	3	6	8903	8908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006873	AT	3	6	8911	8916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006873	TATT	2	8	8927	8934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006873	TTTG	2	8	8974	8981	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006873	ATA	2	6	10576	10581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006873	TTAT	3	12	11241	11252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006873	TA	3	6	11255	11260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006873	CTT	2	6	11768	11773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_006873	TTG	2	6	11780	11785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006873	T	6	6	11801	11806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006873	CGGC	2	8	11808	11815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_006873	T	6	6	11825	11830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006873	TCA	2	6	11891	11896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_006873	AG	3	6	11973	11978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006873	CT	3	6	11987	11992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_006873	TTTAT	2	10	11993	12002	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006873	TA	3	6	12003	12008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006873	TCT	2	6	14399	14404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_006873	TCT	2	6	14420	14425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_006873	A	7	7	14426	14432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006873	TCT	2	6	14528	14533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_006873	TAA	2	6	14548	14553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006873	T	6	6	14556	14561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006873	TTA	2	6	14573	14578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006873	T	6	6	14624	14629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006873	ATA	2	6	14642	14647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006873	TTCC	2	8	14700	14707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_006873	TC	3	6	14713	14718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_006873	TGG	2	6	14725	14730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006873	AAT	2	6	15813	15818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006873	TAA	2	6	21612	21617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006873	CT	3	6	22323	22328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_006873	GAA	2	6	22334	22339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006873	TATT	2	8	24404	24411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006873	TA	3	6	24421	24426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006873	A	6	6	24460	24465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006873	ATC	2	6	24468	24473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_006873	TATTG	2	10	24481	24490	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006873	TTA	2	6	24548	24553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006873	TAT	2	6	24589	24594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006873	GTA	2	6	24604	24609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006873	CTA	2	6	24621	24626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_006873	TGCAA	2	10	24628	24637	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_006873	TTTG	2	8	24734	24741	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006873	GTTT	2	8	24778	24785	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006873	ATA	2	6	24837	24842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006873	ATT	2	6	24848	24853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006873	ATA	2	6	24921	24926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006873	TC	3	6	24992	24997	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_006873	GCAG	2	8	25002	25009	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_006873	ATG	2	6	25084	25089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006873	AG	3	6	25115	25120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006873	AGA	2	6	25147	25152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006873	TTC	2	6	25153	25158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_006873	AT	3	6	25193	25198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006873	AT	3	6	25216	25221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006873	TA	3	6	25222	25227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006873	AT	3	6	25231	25236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_006873	TA	4	8	25241	25248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_006873	T	6	6	25293	25298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_006873	TTC	2	6	25344	25349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_006873	TCA	2	6	25383	25388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_006873	TTTC	2	8	25437	25444	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_006873	TC	3	6	25499	25504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_006873	GT	3	6	30336	30341	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.